分阶段证据链鉴定HET结构域基因水平转移
热点事件观察中
分阶段证据链鉴定HET结构域基因水平转移
1 篇报道1 个报道来源1 天前更新
先了解这件事
AI 综述
Ahmad、Huang等在一篇预印本中提出一套分阶段证据链,用于检验单个水平基因转移候选,并据此在一株Fusarium tricinctum菌株(MPI-SDFR-AT-0068)中鉴定出一个HET结构域基因的近期水平转移,供体为与尖孢镰刀菌复合种(FOSC)相关的谱系。该候选来自对109个基因组、8815个HET结构域(PF06985)蛋白相似性图谱的分析,是其中信号最强的一例。 作者称,证据链的每个阶段都是独立检验,判定规则在运行前即已固定。支持该结论的数据包括:该F. tricinctum拷贝与其最佳FOSC匹配的局部蛋白一致性为98.4%,而全基因组中位数为83%;它与FOSC拷贝的同义分化(中位dS 0.11)低于99.6%的F. tricinctum基因与其最佳F. oxysporum匹配的分化水平;该基因在其姐妹种F. avenaceum的组装中缺失。 上述结果来自预印本,尚未经过同行评审。
AI 根据报道生成 · 1 小时前更新
最新进展10月16日 08:00
分阶段证据链鉴定HET结构域基因近期从与尖孢镰刀菌复合种相关的谱系水平转移至一株Fusarium tricinctum报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月16日
- bioRxiv · Genomics分阶段证据链鉴定HET结构域基因近期从与尖孢镰刀菌复合种相关的谱系水平转移至一株Fusarium tricinctum
研究以分阶段证据链在一株F. tricinctum菌株(MPI-SDFR-AT-0068)中鉴定出一个HET结构域基因的近期水平转移,供体为与尖孢镰刀菌复合种(FOSC)相关的谱系。
本事件热度走势
还没有足够的连续观测数据,暂不绘制趋势。