Modulator算法区分直接RNA测序中的修饰差异

Nelson, T. M. 等作者在 bioRxiv 预印本中提出 Modulator 算法，可在无参考转录组的情况下，从纳米孔直接 RNA 测序数据构建 fragmentform、估计每位点的修饰化学计量，并把差异归类为转录本、等位基因或条件依赖。 作者报告，在对照 HG002 转录组中，该算法构建了 23,746 个 fragmentform，其中 15,620 个候选新异构体携带 poly(A) 信号的频率与已注释转录本相当；同一批读段用于 SNP 调用时，对照 Genome in a Bottle 基准精确率为 93%，未出现定相错误。 在 GLORI 测到的位点上，96% 的 m6A 变化方向与同批样本的单核苷酸分辨率 GLORI 图谱一致。上述为预印本中作者自报的评估结果。

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还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。