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Clonucopya工作流发布:连接肿瘤克隆与用药排序

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AI 综述

Sanchez-Cid等作者发布端到端Snakemake工作流Clonucopya,将亚克隆推断工具PyClone-VI、PhyClone与药物优先排序工具PanDrugs2整合,把肿瘤克隆结构直接关联候选药物。 据作者描述,该工作流从基因组测序数据重建肿瘤系统发育树、量化各样本中克隆层面的占比,并针对每个克隆检出的体细胞突变,对FDA/EMA已批准及实验性治疗候选药物进行排序。作者称通过一个真实世界的纵向、多区域用例评估了其效用,揭示了肿瘤进展过程中具有临床可操作性的克隆动态。 上述效用与临床可操作性均为作者在预印本中的表述,尚未经同行评审证实。

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报道时间线

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10月16日
  1. bioRxiv · Bioinformatics
    Clonucopya:连接肿瘤克隆结构与药物优先排序的端到端工作流

    Clonucopya是一款端到端Snakemake工作流,将亚克隆推断工具PyClone-VI、PhyClone与药物优先排序工具PanDrugs2整合,把肿瘤克隆结构直接关联候选药物。

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