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Falcataria falcata染色体水平基因组组装发布

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AI 综述

Kobayashi, M. J.等作者发布热带含羞草亚科树种Falcataria falcata的染色体水平基因组组装,大小为614.9 Mb,含13条染色体水平支架,BUSCO完整度99.6%。 基于该组装,共线性分析显示含羞草亚科共享保守的大染色体结构,与谱系分化前发生的一次祖先全基因组复制事件相符;但同义替换率(Ks)与保守重复基因的系统发育分析则支持含羞草亚科和蝶形花亚科各自独立发生全基因组复制。 作者还发现,各谱系在全基因组复制后独立产生的近期基因重复Ka/Ks升高,主要与多种生物胁迫的防御响应相关,提示其序列演化更快、功能分化程度高于全基因组复制来源的重复基因。

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报道时间线

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10月16日
  1. bioRxiv · Genomics
    Falcataria falcata染色体水平基因组组装揭示豆科古老多倍化与重复基因演化

    研究发布热带含羞草亚科树种Falcataria falcata的染色体水平基因组组装,大小为614.9 Mb,含13条染色体水平支架,BUSCO完整度99.6%。共线性分析支持该亚科存在早于谱系分化的祖先全基因组复制事件,而Ks与系统发育分析支持含羞草亚科和蝶形花亚科各自独立发生全基因组复制。近期独立产生的基因重复Ka/Ks升高,主要与生物胁迫防御响应相关。

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