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预印本:金属酶从头设计计算流程

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AI 综述

bioRxiv 预印本提出一套金属酶从头设计计算流程:以 Metal Mer 结构单元把骨架几何映射到统计偏好的金属配位模式,再围绕反应产物构建催化核心。作者 Shan, C. 等称,用该流程设计的锌依赖氢转移酶中,一个高选择性变体在 13 种底物上对映体过量(ee)>99%,且未经定向进化。 将该框架用于铁催化烯烃双官能化时,作者称设计变体无需优化即有活性(产率 10%,对映比 70:30),高于此前报道的天然功能类似物(产率<5%,对映比<60:40);单个活性位点残基突变后,若干底物的选择性升至 96:4,与经大量进化的天然酶相当。作者还称一个活性设计变体的晶体结构与计算模型吻合,主链 RMSD 为 0.4 埃。上述结果来自预印本,尚未经同行评审。

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10月16日
  1. bioRxiv · Synthetic Biology
    研究提出基于 Metal Mer 的金属酶从头设计流程

    bioRxiv 预印本提出一套从计算直接设计高效金属酶的流程,以 Metal Mer 结构单元将骨架几何映射到统计偏好的金属配位模式,再围绕反应产物构建催化核心。

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