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研究提出二倍体基因型谱估算自交率

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AI 综述

McKenzie 等作者提出二倍体基因型谱(DGS),作为刻画部分自体受精群体的基因组数据摘要,并据此给出从群体基因组数据估算自交率的方法。 在标准溯祖近似下,作者给出分离位点上 DGS 构型期望相对频率的递归与组合两种计算方式,并用正向模拟验证分析预期,同时发布可从二倍体 SNP 数据估算群体自交率的软件包。

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报道时间线

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10月16日
  1. bioRxiv · Genomics
    利用二倍体基因型谱估算自体受精率

    研究提出二倍体基因型谱(DGS)作为刻画部分自体受精群体的基因组数据摘要,并给出从群体基因组数据估算自交率的方法。在标准溯祖近似下,可计算分离位点上DGS构型的期望相对频率,研究提供递归与组合两种计算方式,并用正向模拟验证分析预期,同时发布从二倍体SNP数据估算群体自交率的软件包。

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