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NeoOmni Atlas泛癌新抗原数据库发布

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AI 综述

Zheng, T.等作者发布并公开了NeoOmni Atlas泛癌T细胞表位数据库,该数据库通过对26种癌症、2,341份样本的7,561套免疫肽组学数据集(5.11亿张原始谱图)进行蛋白质基因组学再分析建成,可免费访问。 分析共得到872,414条洗脱的经典肽和198,961条非经典肽,覆盖18类分子改变,以及由322种HLA等位基因呈递的759,386个独特配体。作者用计算性肿瘤特异性过滤框架识别出316,126个肿瘤相关表位和61,231个肿瘤特异性表位,并称后者对HLA I类A、B等位基因的预测结合亲和力强于肿瘤相关表位;另有65个在10种以上肿瘤类型中重复出现的保守肿瘤特异性表位,被视为潜在的共享抗原候选。 上述表位数量与结合亲和力比较均为作者基于计算分析得出的结果,尚未经实验验证。

AI 根据报道生成 · 52 分钟前更新

报道时间线

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10月16日
  1. bioRxiv · Bioinformatics
    NeoOmni Atlas:基于蛋白质基因组学分析构建的泛癌新抗原整合数据库

    NeoOmni Atlas 通过对26种癌症、2,341份样本的7,561套免疫肽组学数据集(5.11亿张原始谱图)进行蛋白质基因组学再分析,建成可交互的泛癌T细胞表位资源。

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