SMARTFlexDB配对apo-holo RNA结构数据库发布
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SMARTFlexDB配对apo-holo RNA结构数据库发布
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AI 综述
Jiang, S.等作者发布SMARTFlexDB,一个基于配对apo-holo RNA结构的数据库与分析平台,用于表征RNA构象差异及RNA-小分子识别。 当前版本包含266个holo结构中的434个结合口袋,关联186个apo结构,产生1,187个口袋级apo-holo配对,组织为734条数据库条目,覆盖150种小分子和23个RNA功能类别。候选配对通过匹配序列同一性和覆盖率均不低于90%、且结合口袋核苷酸完全保守的RNA链从蛋白质数据库(PDB)中筛选。 数据库与分析平台可通过 https://aidd.rc.ufl.edu/app/smartflexdb/ 访问。
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最新进展10月15日 08:00
SMARTFlexDB:配对apo-holo RNA结构数据库及RNA构象灵活性与小分子识别分析平台报道时间线
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10月15日
- bioRxiv · BioinformaticsSMARTFlexDB:配对apo-holo RNA结构数据库及RNA构象灵活性与小分子识别分析平台
SMARTFlexDB是一个基于配对apo-holo RNA结构的数据库与分析平台,用于表征构象差异及RNA-小分子识别。当前版本包含266个holo结构中的434个结合口袋,关联186个apo结构,产生1,187个口袋级apo-holo配对,组织为734条数据库条目,覆盖150种小分子和23个RNA功能类别。
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