非洲绿松石鳉基因组近完整组装与重复序列解析
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非洲绿松石鳉基因组近完整组装与重复序列解析
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AI 综述
Ogawa等作者在bioRxiv发布预印本,报道非洲绿松石鳉(Nothobranchius furzeri)改进的染色体级基因组组装,称其与实验估计的基因组大小和染色体数目相符,并解析出占全基因组最高28.0%的高度扩增串联重复序列。 作者比较了重复序列检测流程:串联重复检测方式的选择会改变所呈现的转座元件图谱;不同转座元件分析流程共享大部分转座元件来源区域,但各自找回的年龄和性别相关转座元件位点并不重合。这些位点评估基于一个性别均衡的鳉鱼多组织衰老队列。上述组装与检测结果均为预印本报告,尚未经同行评审证实。
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最新进展10月16日 08:00
非洲绿松石鳉鱼近完整基因组组装实现转座元件表达的位点级分析报道时间线
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10月16日
- bioRxiv · Genomics非洲绿松石鳉鱼近完整基因组组装实现转座元件表达的位点级分析
研究发布非洲绿松石鳉鱼(Nothobranchius furzeri)改进的染色体级基因组组装,与实验估计的基因组大小和染色体数目相符,并解析出占全基因组最高28.0%的高度扩增串联重复序列。
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