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MOFI多组学框架重建细胞命运转变

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AI 综述

预印本作者 Shen, J. 等提出动态约束的多组学整合框架 MOFI,用于从多个时间点采样的配对多组学快照重建连续的细胞命运转变,联合建模组学特异状态动态、跨组学对应与共享群体增长。作者称,此前每个细胞仍只被观测一次,连接离散快照的连续多组学轨迹尚未解决。 作者称,在模拟基准和配对 RNA-ATAC/RNA-蛋白时间序列数据上,MOFI 重建出与观测一致的连续命运转变、群体动态和跨组学变化;在肾脏类器官中捕获肾单位谱系特化的 RNA-ATAC 协同进程;在造血祖细胞中预测扰动响应的谱系重分布,并提出连接转录模块与蛋白水平响应的多组学转化程序。上述结果来自预印本,尚未经同行评审。

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报道时间线

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10月16日
  1. bioRxiv · Bioinformatics
    MOFI 揭示细胞命运进程中的动态多组学协调

    研究提出动态约束的多组学整合框架 MOFI,用于从多时间点配对多组学快照重建连续细胞命运转变,联合建模组学特异状态动态、跨组学对应与共享群体增长。

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还没有足够的连续观测数据,暂不绘制趋势。