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PatientPheX患者表型抽取语料库发布

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AI 综述

Zhu X等作者发布PatientPheX全文本生物医学语料库,用于患者特异性表型信息抽取。该语料库包含200篇全文文献,以病例报告和病例系列为主,标注了七类生物医学实体的提及与规范化,以及患者与实体在句子、段落和章节层面的关联,并标注否定发现和复合表型提及。 作者报告,文档级实体F1为86.95%,表型F1为79.33%;最佳关系抽取宏F1在使用金标准实体时为84.14%,使用预测实体时降至54.98%,作者称这体现了表型抽取与患者归属的双重挑战。

AI 根据报道生成 · 7 小时前更新

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10月15日
  1. bioRxiv · Bioinformatics
    PatientPheX:面向患者特异性表型信息抽取的全文本生物医学语料库

    PatientPheX是一个面向患者特异性表型信息抽取的语料库,包含200篇全文文献,以病例报告和病例系列为主,标注了七类生物医学实体的提及与规范化及患者与实体在句子、段落和章节层面的关联,并标注了否定发现和复合表型提及。

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