bioRxiv · Bioinformatics· tamby, s., Bujupaj, A., orlando, g. ·2026-10-16 08:00· 1 天前AI 评分41

隐函数定理助力蛋白质力场自动重参数化：面向淀粉样纤维的AMBER力场再参数化

The (implicit) force is with you: an application of the implicit function theorem for automatic protein force fields reparametrization

AI 导读

研究提出将通用性从力场本身转移到参数赋值方法上，通过双层优化与隐函数定理实现受限同质蛋白类的系统重参数化。以淀粉样纤维为例对AMBER力场再参数化，优化后参数与实验结构更吻合，并提升了分子动力学模拟中的纤维稳定性。