USC科学家发现可创建抗癌细胞无限供应的方法
南加州大学（USC）科学家发现，在受控实验室条件下，粒细胞-单核细胞祖细胞（GMPs）可长期自我更新并大量扩增，同时保留分化为功能性免疫细胞的能力，经基因改造后可识别肿瘤。相关研究发表于Cell，在小鼠实验中工程化细胞定植骨髓、产生新免疫细胞，并减缓血液肿瘤和实体瘤进展。该GMP平台由USC干细胞团队开发，被认为可为癌症免疫治疗提供可规模化、可工程化的细胞来源。
ScienceDaily · PharmaceuticalsAI 评分4040 ScienceDaily · BiotechnologyAI 评分2222 康斯坦茨大学科学家发现可降解特定聚酯与青霉素的“吃塑料”Pac-Man酶
德国康斯坦茨大学研究人员发现一种被昵称为“Pac-Man酶”的酶，可分解特定聚酯和可生物降解塑料，还能分解青霉素，提示可能与抗生素耐药性存在关联。团队将长链脂肪族聚酯（LCAP）生物塑料薄膜埋入大学植物园森林土壤约10厘米深处，并在实验室用同源土壤测试，结果显示所有生物塑料材料在约250至330天内完全降解，纤维素约80天降解，高密度聚乙烯（HDPE）几乎不降解。
bioRxiv · Synthetic BiologyAI 评分2424 利用真菌“高速公路”构建地下生物传感器：合成跨界网络实现土壤中信号传播
研究将丝状土壤真菌 Lyophyllum atratum 与工程化运动细菌生物传感器 Pseudomonas putida 组成跨界网络，在垂直土柱和水平土盘模型中传播合成基因回路激活信号。
bioRxiv · Synthetic BiologyAI 评分2424 自延伸DNA记录实现随机与编程写入：Infinite Printer架构
研究提出Infinite Printer，一种将自延伸与可写末端再生偶联的CRISPR记录架构，由自靶向prime-editing guide RNA（stpegRNA）引导重复延伸，碱基编辑原位产生多样性。
bioRxiv · Synthetic BiologyAI 评分2020 冰驱动功能性原细胞的形成
一项发表于bioRxiv的研究显示，冻融（FT）过程可将分子浓缩、细胞大小膜区室形成与生化系统激活耦合起来。原位成像显示，缓慢冷冻时化学多样的溶质与膜材料在冰限域液区中共浓缩，随后缓慢解冻形成捕获浓缩分子的细胞大小巨型囊泡。这些过程能在囊泡内组装多组分转录-翻译系统（PURE系统），使原本在体相溶液中几乎无活性的稀释混合物实现蛋白质合成。
bioRxiv · Synthetic BiologyAI 评分5858 研究提出基于 Metal Mer 的金属酶从头设计流程
bioRxiv 预印本提出一套从计算直接设计高效金属酶的流程，以 Metal Mer 结构单元将骨架几何映射到统计偏好的金属配位模式，再围绕反应产物构建催化核心。
bioRxiv · Synthetic BiologyAI 评分2222 合成生物学引导的模块化工程改造分泌型角质酶FoCut5a：融合碳水化合物结合模块提升解脂耶氏酵母中聚酯-聚氨酯解聚
研究在解脂耶氏酵母中建立组合合成生物学策略，将来自尖孢镰刀菌的角质酶FoCut5a与四种分泌信号、四种结构域间连接子和六种底物结合域组合，构建96个Golden Gate组装体定点整合至基因组，筛选聚酯-聚氨酯分散体Impranil DLN-SD的解聚效果。
bioRxiv · Genomics精选AI 评分6060 研究提出人类基因组的关系架构，识别跨编码与非编码区的定向模块
研究团队用Nucleotide Transformer v3在百亿亿次算力集群上系统扰动完整端粒到端粒人类基因组，生成核苷酸分辨率依赖图谱，构建出有向加权的位点间基因组关系网络。该网络重现已知生物学特征，并识别出跨编码、非编码和未注释区域的重复定向架构，称为relons。这些关系模块反映进化与功能约束，并与人类遗传变异和致病变异相关，研究提出基因组在序列与三维结构之外存在更高阶的关系层。
bioRxiv · BioinformaticsAI 评分1818 基于HiRepEat的LTR反转录转座子家族高效精准发现
研究团队将Myers O(Nd)波前比对算法适配为新的LTR检测、聚类与系统发育信息共识方法HiRepEat，用于在新基因组序列中识别LTR-RT家族。
bioRxiv · BioinformaticsAI 评分2929 基于纵向单细胞拷贝数图谱的活检感知系统发育重建：Cancer Tree Biopsy Framework (CTBF) 方法
Cancer Tree Biopsy Framework (CTBF) 提出活检引导重建方法，将拷贝数图谱与其在不同活检中的独立观测区分，连接连续样本、推迟模糊亲本分配并补全未解析祖先。
bioRxiv · BioinformaticsAI 评分3838 促进生物医学图像合成中的有效统计推断
针对合成医学图像因忽略临床相关协变量、且被当作观测数据直接分析而导致患者表型与合成图像间关联严重衰减的问题，研究提出无需模型重训的分析框架Phenotype Aware Multiple Synthesis（PAMS），通过调整合成输出恢复有效生物学估计并校准不确定性。在MRI与多重免疫荧光（mIF）数据上，PAMS降低了估计偏差并恢复了名义置信区间覆盖率，且与现有合成流程兼容。
bioRxiv · BioinformaticsAI 评分4141 HighFold-Lasso：利用AlphaFold3的拓扑引导套索肽结构预测
HighFold-Lasso结合定制共价连接与套索支架引导的自适应低噪声初始化，实现由套索构象先验引导的条件结构生成。在52个实验测定结构的测试集上，其套索拓扑成功率达100%，环-环区域C-alpha平均RMSD为1.942埃，完整肽为2.375埃。该框架支持四类经典套索肽（I-IV）建模，并可表示非经典氨基酸。