SCOTE空间协方差张量框架发布

Ilin等人提出计算框架SCOTE（Spatial COvariance TEnsors），可在所有长度尺度上量化所有特征对的空间关系，同时适用于分子坐标和分箱计数两类空间组学数据。 据作者报告，SCOTE的分子级函数在小鼠脾脏中解析出细胞级分析遗漏的基因敲除效应，并显示决定统计误差的是组织面积与重复数，而非分子深度；该框架在单块GPU上26分钟即可处理十亿分子全转录组切片的所有长度尺度及不确定性，并可在CPU和GPU上运行。上述效果均为作者在预印本中的报告。

AI 根据报道生成 · 42 分钟前更新

还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。