bioRxiv · Bioinformatics· Ilin, M., Singh, Y., Mages, S. W. ·· 18 小时前AI 评分38
SCOTE:尺度分辨相关函数统一跨平台与分辨率的空间组学分析
Scale-resolved correlation functions unify spatial omics across platforms and resolutions
AI 导读
研究提出计算框架SCOTE(Spatial COvariance TEnsors),可在所有长度尺度上量化所有特征对的空间关系,适用于分子坐标与分箱计数数据。其分子级函数在小鼠脾脏中解析出细胞级分析遗漏的基因敲除效应,并显示组织面积与重复数而非分子深度决定统计误差。SCOTE在单块GPU上26分钟处理十亿分子全转录组切片的全部长度尺度及不确定性。
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