SLAFIT：三代测序病毒适应度与结构变异检测流程

Abdullah, S. M. U. 等作者发布预印本，介绍一款名为 SLAFIT 的流程，可从三代测序数据中做连锁感知的适应度推断和结构变异（SV）检测。该流程重建全基因组单倍型及其频率，据此推断单核苷酸变异并估计连锁不平衡；在有时间序列数据时还能推断适应度，并把已有 SV 检测工具纳入同一工作流。 作者称，模拟显示在测试条件下连锁不平衡与适应度推断准确，并行化缩短了计算时间。应用于肠道病毒 C104 和单纯疱疹病毒 1 型时，分别揭示预测表位上的选择信号、找回一个已知倒位。这些为预印本报告的结果，尚未经同行评审确认。

AI 根据报道生成 · 2 小时前更新

还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。