bioRxiv · Genomics· Trinca, V., Prosdocimi, F., Cortes-Barros, P., de Moraes, A. P., Almeida, M. C., Paschoal, A. R., da Silva, S. R., Miranda, V. F. O., Barbosa, J. B. F., Oliveira, D. R., Lopes, S. S. S., Varani, A. M. ·· 1 天前AI 评分18
亚马逊死藤水藤本植物Banisteriopsis caapi染色体级比较基因组学揭示古多倍体祖先与近期串联基因扩张作为民族变种分化候选特征
Comparative chromosome-scale genomics of the ayahuasca liana Banisteriopsis caapi reveals paleopolyploid ancestry and recent tandem-gene expansions as candidate signatures of ethnovariety differentiation
AI 导读
研究对caupuri与tucunaca两个民族变种完成染色体级基因组组装，大小分别为1.16 Gb和1.13 Gb，各含10条染色体级假分子。两基因组均保留两次古伽马复制后事件的痕迹，约78%组装序列为重复DNA，以LTR逆转录转座子为主。两变种在结构变异、重复序列组成和基因家族谱上存在差异，民族变种偏向性差异候选来自基因家族重塑、LARD与LTR相关基因组邻域及较近期串联重复基因阵列的局部扩张。
来源：bioRxiv · Genomics · biorxiv.org