bioRxiv · Bioinformatics· Furqon, A. D. C., Wick, R. R., Roberts, L. W., Hall, M. B. ·2026-10-16 08:00· 1 天前AI 评分36

评估纳米孔测序reads修剪与质量过滤在细菌基因组学中的表现

Evaluating Nanopore read trimming and quality filtering in bacterial genomics

AI 导读

研究基准测试了17种预处理组合，由Dorado、Porechop_ABI、Barbell三种接头修剪工具与Filtlong、Chopper、SeqKit三种质量处理工具及未处理对照构成，另加Fastplong，在13株细菌分离株、100x与20x深度、HAC与SUP碱基识别模型下评估。