氯胺酮诱导人iPSC来源神经元的突触与单胺能重塑
一项发表于Translational Psychiatry的研究显示,氯胺酮(1 µM,处理72小时)可显著增加人iPSC来源前脑神经元突触后支架蛋白PSD-95的突触定位,并选择性调控Akt通路,但不改变BDNF蛋白水平或MAPK激活。
一项发表于Translational Psychiatry的研究显示,氯胺酮(1 µM,处理72小时)可显著增加人iPSC来源前脑神经元突触后支架蛋白PSD-95的突触定位,并选择性调控Akt通路,但不改变BDNF蛋白水平或MAPK激活。
一项在链脲佐菌素诱导的糖尿病大鼠模型中开展的研究,评估未分化骨髓来源间充质干细胞(MSC)对凋亡、炎症和细胞应激相关基因表达的影响,并观察胰腺与脾脏组织学和蛋白表达变化。研究使用40只雌性Sprague–Dawley大鼠,10只雄性大鼠作为骨髓供体,实验经Alexandria大学医学院伦理委员会批准(No. 0306187/2023)。
研究在免疫缺陷 RetS812F/+ 小鼠中观察到局部肠道神经缺陷及神经介导的肛门直肠收缩力降低。该研究由 T-CiRA、CIEM、神户大学与京都大学 CiRA 等机构合作完成,通讯作者为 Makoto Ikeya,发表于 Sci Rep,DOI 见原文。
研究团队提出模块化深度学习系统CytoLens,用于宫颈细胞学定量分析,可检测并计数细胞核、分割核与全细胞、测量核质面积比(N:C)、对多焦图像细胞分类并给出异常评分。
研究团队对帕金森病精准医学计划832名参与者的850份血浆和1200份脑脊液样本开展纵向高通量蛋白质组检测,建立蛋白质组质控指标并改进疾病进展的临床度量。研究识别出68个血浆和3个脑脊液疾病负担标志物、4个血浆疾病活动标志物,并将96个血浆蛋白和34个脑脊液蛋白与12种抗帕金森药物的剂量相关联。
推荐理由:基于832名帕金森病患者血浆与脑脊液样本,梳理疾病负担、疾病活动与用药剂量相关的蛋白标志物,为客观监测提供方法框架。
一项针对281名以黑人为主的社区居住老年人的研究显示,邻里社会经济地位越低,认知障碍风险越高;而环境负担越重,认知障碍风险反而越低,且该关联以受教育年限为调节因素,在受教育程度高者中最强。环境正义指数(EJI)的两个综合评分与认知障碍无关联,提示综合指标可能掩盖邻里特征对认知的独立作用路径。
基于81,870名45-87岁UK Biobank参与者,研究构建了Meynert基底核(Ch4)与隔区/斜角带(Ch1-3)灰质体积的年龄和性别特异性规范模型,并计算个体偏离度。两分区随年龄呈现可区分的结构轨迹,纵向数据中持续存在;偏离集中于Ch4,Ch1-3几乎未见更大偏离。Ch4缺陷在诊断前数年即可检出,与痴呆和帕金森病发病相关,且不能由常见遗传风险充分解释。
研究提出机器学习系统 inClinico Agent,可预测 I-IV 期临床试验成功与否,并分别建模疗效终点与安全性/毒性终点。
基于2023年柬埔寨STEPS调查289个地理参照初级抽样单元,研究以带二维高斯过程平滑的二项广义可加模型分析血压升高的空间分布。在4,225名有有效血压数据的成人中,未加权患病率为28.6%,经Step-2加权后为18.8%,农村加权患病率17.5%、城市/郊区21.7%。
研究利用人iPSC来源肝类器官模型再现Wolman病的多细胞组织反应,并实现治疗性挽救。人肝组织采集获意大利Friuli Venezia Giulia大区伦理委员会批准(protocol no. 0033969, 26 August 2024),参与者均签署书面知情同意;小鼠样本相关动物程序获CEEA-51伦理委员会批准(APAFIS no. 33620-2021101416506495)。
PatientPheX是一个面向患者特异性表型信息抽取的语料库,包含200篇全文文献,以病例报告和病例系列为主,标注了七类生物医学实体的提及与规范化及患者与实体在句子、段落和章节层面的关联,并标注了否定发现和复合表型提及。
一项研究将社区居住日本成人的习惯性膳食评估与既往健康记录及同期临床化学、血清代谢组学和血清拉曼光谱相衔接,发现较高膳食质量对应更有利的既往健康特征,但未在同期多变量表型中界定离散状态。拉曼光谱对多个膳食变量提供了补充于临床和代谢组学测量的预测信息,其中与β-胡萝卜素当量对应的拉曼变异可追溯至类胡萝卜素归属谱带,并与更广泛的植物性食物相关膳食维度一致。
SMARTFlexDB是一个基于配对apo-holo RNA结构的数据库与分析平台,用于表征构象差异及RNA-小分子识别。当前版本包含266个holo结构中的434个结合口袋,关联186个apo结构,产生1,187个口袋级apo-holo配对,组织为734条数据库条目,覆盖150种小分子和23个RNA功能类别。
一项研究将近端粒到端粒的二倍体组装与匹配黑色素瘤的深度长读长测序配对,发现16%的体细胞变异位于GRCh38缺失的序列中。卫星重复序列吸收紫外线损伤,动粒结合结构域同时累积遗传与表观遗传变异,体细胞表观突变主导了改变的调控景观。
ClinicalTrials.gov 登记一项研究,测试 CRISPR/Cas9 编辑的自体 CD34+ 造血干/祖细胞(HSPCs)单次输注治疗重度镰状细胞病(SCD)的安全性,并观察其能否提高胎儿血红蛋白(HbF)水平、减轻 SCD 症状。主要目标为评估该自体输注的安全性,次要目标为评估其疗效。
一项临床试验将测试碱基编辑造血干/祖细胞基因疗法治疗CXCR4-WHIM综合征,该病由CXCR4基因突变引起,药物可控制感染但无法治愈。研究分4阶段:筛查(含骨髓活检)、单采收集干细胞并基因编辑、住院约4周接受3种药物预处理后回输编辑细胞、5年内8次随访并延续15年长期随访。受试者为3岁及以上WHIMs患者。
斯坦福大学Wernig实验室在Nature发表研究,题为Elp1 is required for myeloid differentiation and brain repopulation,通过CRISPR敲除筛选和小鼠移植实验表明Elp1缺失影响髓系细胞分化及脑内再定植。
一项发表于 Scientific Reports 的研究探索外周血单核细胞(PBMC)作为周围神经损伤线粒体移植的微创来源。研究从大鼠和人 PBMC 及脂肪来源干细胞中分离出功能线粒体,在大鼠坐骨神经挤压伤和 10-mm 节段性缺损(以脱细胞神经同种移植物桥接)模型中评估疗效。
一项追踪肺泡2型(AT2)细胞的研究显示,气道损伤后AT2细胞可在肺不同区域间迁移并转变为细支气管细胞,帮助修复受损气道。该研究由Liu, K.等人完成,论文题为《Alveolar stem cells transdifferentiate to drive bronchiolar regeneration》,发表于Nature(2026)。
通过5个月活体显微成像追踪Krt14 creER;iChr-control-mosaic小鼠耳部皮肤克隆动态,发现表皮维持依赖局部协调的随机干细胞更新,分化需经增殖潜力有限的中间TA细胞样状态。克隆动态显示姐妹细胞事件的时间协调在雌性小鼠中显著富集,功能实验将该协调与性激素调控基底细胞动态相关联。
研究团队应用原位冷冻电子断层扫描与子断层平均技术分析人类多纤毛上皮细胞,在亚纳米分辨率下解析了纤毛过渡区特异性二联微管,并鉴定出九种组成蛋白。研究发现上皮细胞转化2样蛋白(ECT2L)和含双锌带及锚蛋白重复序列蛋白1(DZANK1)构成相邻过渡区二联微管间的主要连接复合物,两基因的双等位功能缺失变异均导致原发性纤毛运动障碍。
研究发现Notch靶蛋白Hes1(hairy and enhancer of split 1)呈振荡表达,以频率依赖方式控制小肠干细胞向吸收型和分泌型细胞的分化。内源性荧光Hes1报告系统显示,沿隐窝-绒毛轴存在细胞类型特异的振荡频率梯度,受细胞周期阶段及Wnt、Notch信号活性调控。团队用微流控系统调节类器官中Notch信号振荡,发现振荡频率可调控细胞类型组成平衡。
一项整合转录组学研究通过差异表达分析与加权基因共表达网络分析,鉴定出10个hub基因,其中EPB42、KLF1和H3F3A被优先用于进一步评估。EPB42在CKD中表达降低而在ESRD中升高,呈现两疾病状态间的反向表达模式;KLF1在健康对照与CKD间无显著差异但ESRD中升高,H3F3A在CKD中升高并在ESRD中进一步升高。
Cell刊发Howard等人的研究,揭示母乳糖蛋白骨桥蛋白通过塑造新生儿微生物组调控造血,促进树突状细胞发育并抵御严重呼吸道感染。该研究提出一条母源乳汁-微生物群通路,将生命早期营养与免疫发育及长期疾病易感性相关联。
SMaHT Network(Somatic Mosaicism across Human Tissues Network)开展的基准测试表明,测序与分析技术的进步现已能够系统、全面地发现非癌组织中的多种类型体细胞突变,覆盖从端粒到端粒的整个基因组。
日本大阪大学等团队在npj Regenerative Medicine发表研究,将人诱导多能干细胞(hiPSCs)的空间图案化自形成外胚层自主多区(SEAM)分化与晶状体优化培养基(LOM)结合,建立体外晶状体形态发生平台。
美国国家癌症研究所(NCI)发布有限竞争资助机会通知(NOFO),征集申请以继续支持两个生物样本库资源:NCTN Biobanks和EET Biobank。NCTN Biobanks支持NCI资助的NCTN及社区肿瘤研究计划(NCORP),EET Biobank支持实验治疗临床试验网络(ETCTN)及其他NCI支持的早期和实验性临床试验。申请将经NIH标准同行评审,仅优秀申请可获资助。
美国国家补充与综合健康中心(NCCIH)发布资助机会通知,征集身心干预多中心可行性试验申请,要求R33临床试验。该类早期多中心试验需验证干预跨中心实施保真度、情绪健康(EWB)靶向机制的可重复性、受试者招募保留与随机化可行性、跨中心采集整体健康恢复临床数据与EWB机制数据的可行性,并探索机制靶点变化与临床结局的关联。
bioRxiv预印本提出核糖核苷酸切除修复(RER)缺陷会在全基因组层面产生特征性插入缺失、替换和结构变异突变表型,并据此开发出全基因组分类器RERDetect。
蝾螈肢体再生中,骨骼整合机制是否因截肢部位组织组成不同而异尚不清楚。研究比较了影响同一骨骼元件但细胞与ECM组成不同的两个截肢平面,发现骨吸收特异性由钙化骨干截肢触发,主要用于再生整合;空间转录组与bulk RNA-seq显示RANK/RANKL系统可能在截肢后3天即调控破骨细胞分化,趋化因子Loc483参与促进其分化或招募,截肢部位还可诱导AEC显著转录组差异。
SMaHT Network发布基准论文及全身体细胞嵌合图谱,聚焦人体内数万亿个存在细微差异的基因组所构成的嵌合现象。该评论指出这一新可测量的变异对发育、衰老和疾病的意义。
Shiying Liu与Shi-Yan Ng在PLOS Biology发表观点文章指出,神经炎症和血管功能障碍是多数神经退行性疾病的标志,因此免疫细胞和血管细胞应被视为神经退行性疾病建模类器官的基本组成部分,而非可选添加项。
NIH发布跨学科团队协作计划资助(RM1 临床试验可选)资助机会通知,支持由三至六名项目主任/首席研究员(PDs/PIs)组成跨学科研究团队,攻关具有雄心和挑战性的研究问题。协作团队须整合运作、围绕单一聚焦科学目标协同攻关,该目标应无法通过个人努力或项目集合实现。通知鼓励团队考虑能带来领域重大进展的深远目标。
研究以干细胞分化为模型,绘制转录因子RUNX2内在无序区(IDR)的功能序列特征,发现RUNX2需要其C端IDR才能在成骨过程中结合染色质并调控基因表达。线性IDR序列并非必需,构象集合特征反而可预测功能。研究者据此开发基于生物物理原理的IDR理性设计算法,并从头生成功能性IDR,将生成式蛋白质设计拓展至折叠蛋白质组之外。
NIH 参与的各研究所、中心与办公室发布资助机会通知,邀请申请人提交研究者发起的 Program Project(P01)申请。P01 支持围绕特定重大科学目标或主题的广泛多学科研究计划,由具有共同核心科学主题的研究项目、一个行政核心及可选的共享资源核心组成,聚焦参与 ICO 的科学使命与项目兴趣。
清华大学等团队在 Nature 发表研究,用化学诱导全能干细胞(ciTotiSCs)构建小鼠胚胎模型 ciToti-EMs,可模拟从着床前到 E8.5 阶段的胚胎发育。
推荐理由:该研究用化学诱导全能干细胞构建小鼠胚胎模型,并系统比对自然胚胎各阶段转录组,可供了解胚胎模型构建与评估方法。
六种蛋白质组衰老时钟首次被部署在一项临床试验中。该试验揭示的更多是关于这些衰老时钟本身的信息,而非所测试药物的信息。
一项发表于Nature Biotechnology的研究开发了靶向自然杀伤(NK)细胞的脂质纳米颗粒NtLNPs,通过工程化双靶向NK细胞配体驱动受体特异性摄取和mRNA递送,在小鼠中实现最高约80%的NK细胞转染且脱靶效应极小。
推荐理由:介绍一种用双靶向配体脂质纳米颗粒在小鼠体内直接生成CAR NK细胞的方法,并给出自身免疫病与实体瘤模型中的验证结果。
美国国家关节炎、肌肉骨骼和皮肤疾病研究所(NIAMS)就NIAMS P30 Centers Program征集申请,支持其皮肤生物学与疾病、骨肌与骨科研究、风湿病学使命领域内的综合性研究中心。该项目资助的中心提供协调研究基础设施、共享资源与方法学专长,以推进基础、转化和临床研究,并促进数据科学、人工智能和实施研究等新兴领域的培训。该资助类型为P30,不允许临床试验。
该资助机会通知(NOFO)旨在支持SenNet数据协调与整合中心(SenNet DCIC),作为NIH Common Fund细胞衰老网络(SenNet)第二阶段的核心组成部分。